1、操作上的區(qū)別：直接支付是直接上報財政局。而授權(quán)支付客戶必須先向財政部申請支付財務(wù)批準；

2、指令提供者的區(qū)別：財政直接支付由財政部門向中國人民銀行以及代理銀行簽發(fā)支付指令，財政授權(quán)支付由預算單位按照財政部門的授權(quán)，自行向代理銀行簽發(fā)支付指令；

3、支出內(nèi)容的區(qū)別：工資、購買消費、轉(zhuǎn)移等支付支出屬于直接支付的內(nèi)容，而其他的購買或零散的消費支出，為實行財政直接支出的均屬于授權(quán)支付內(nèi)容。

財政直接支付方式

直接支付方式下獲得財政補助的程序：上市公司需要支付財務(wù)資源時，必須根據(jù)財政部預算和支出計劃直接向財政部提出支付申請。經(jīng)財政部門核對后，財務(wù)部門會通過零余額賬戶直接向收款人支付款項。因此，當代理人收到了銀行分配給財務(wù)部門的財務(wù)余額賬戶付款信息時，上市公司必須按照財務(wù)部門實際支付的金額計算財務(wù)補貼。即財政直接支付方式下，事業(yè)單位在實際使用了財政資金的同時確認財政補助收入。